La Trama

Alla fine del primo film la città appare tranquilla, ma l'imprevisto si nasconde sempre dietro l'angolo, un giovane ragazzo , il quale lavora come fattorino in una pizzeria, viene una sera incaricato di consegnare una pizza alla signorina April o’Neil, con la sua motocicletta vola a consegnarla ma quando arriva sul posto, si accorge che è in corso una rapina in un negozio, entra e neutralizza due dei ladri; il ragazzo è un esperto di arti marziali, ma i ladri sono in numero maggiore.

Quando per lui sembra finita, arrivano le Tartarughe Ninja, le quali neutralizzano i ladri e scappano via con la pizza dopo aver pagato il ragazzo e aver legato i ladri come salami !
Le Tartarughe dopo la battaglia con Shredder nel primo film, vivono ora nella casa di April, siccome il loro covo era ormai stato scoperto dal Clan del Piede e non potevano più tornarci.
Mentre tutti pensano che Shredder sia morto, è ancora vivo e assetato di vendetta.
In una vecchia discarica, il Clan del Piede sta risorgendo. Shredder inizia ad attuare un piano per vendicarsi. Vuole le Tartarughe morte! Decide quindi di mandare uno dei suoi uomini nella troupe di April , la quale sta svolgendo un servizio per una famosa compagnia.

L’infiltrato di Shredder , durante il servizio di April alla TGRI , trova una pianta chiamata “Dente di Leone” , diventata gigantesca grazie all’agente mutageno Ooze, che si è liberato da alcuni fusti nascosti sotto terra dalla fabbrica che lo produceva. E Schredder lo viene a sapere…

Nel frattempo Splinter vedendo il servizio di April in TV, viene a conoscenza che la ditta si chiama TGRI, la stessa sigla impressa sul fusto che tramutò le Tartarughe in umanoidi e Splinter in titanica nutria del Mississipi. Sotto suo consiglio le Tartarughe decidono dunque di infiltrarsi nei laboratori della TGRI; nel frattempo anche il Clan del Piede entra nel laboratorio per rubare un fusto di mutageno, un altro scontro inizia fra le Tartarughe Ninja e il Clan del Piede. Dopo una furiosa battaglia, gli uomini di Shredder riescono ad impossessarsi del contenitore e del professore responsabile del progetto mutageno …

Le Tartarughe tornano meste a casa di April, quando ad un tratto, alla porta suona quel ragazzo delle pizze che ha purtroppo scoperto il segreto dei nostri eroi; Splinter decide quindi di raccontargli la loro storia , il nome di questo ragazzo è Kinon , e conosce il Clan del Piede, rivela così alle Tartarughe di aver scoperto che sta reclutando nuovi allievi.

Intanto, Shredder costringe il professore ad usare il mutageno su degli animali, due nuovi mutanti stanno per nascere …
Le Tartarughe decidono di lasciare la casa di April per cercare una nuova casa nelle condutture , Raffaello , contrariato perché i suoi fratelli preferivano cercare prima casa e dopo il Clan del Piede, lascia il gruppo. Dopo un lungo girovagare Leonardo, Michelangelo e Donatello, trovano un nuovo rifugio.
Shredder riesce nel suo intento, ora ha due nuovi mutanti, la tartaruga Tokka e il lupo Rahzard ! Ma qualcosa va storto, il loro comportamento è infantile, per niente malvagio come voleva Shredder, in compenso, sono in possesso di una forza fisica fuori dal comune, quindi decide di tenerli con lui.

Intanto Kinon, con l’aiuto di Raffaello, si infiltra come matricola nel Clan del Piede, ma vengono scoperti, e dopo uno scontro, la Tartaruga, prima di essere catturata, dice al ragazzo di scappare ed avvisare i suoi compagni.

Le Tartarughe si infiltrano nel covo del Clan e, dopo aver neutralizzato le guardie, trovano Raffaello cadendo però in una trappola tesa da Shredder.
In quel momento arriva Splinter , il quale libera le Tartarughe e dopo un duello con i soldati del Piede entrano in scena i due mutanti Tokka e Rahzard che, nonostante la loro stupidità, sono fortissimi. Per fortuna Michelangelo trova un tombino attraverso il quale fuggire, insieme al professore liberato da Donatello.

Il professore racconta alle tartarughe che 15 anni prima alcune sostanze chimiche, mescolatesi casualmente, formarono questo agente mutageno , e che alcuni fusti furono persi o nascosti; intanto per le strade della città, Tokka e Rahzard creano un evidente disagio ed April viene rapita dal Clan del Piede. Uno di loro intima ad April di mandare un messaggio alle Tartarughe: se non fossero andati all’appuntamento di Shredder , avrebbe rimandato Tokka e Rahzard in giro per la città.

Con l’aiuto del professore, le Tartarughe preparano un anti-mutageno, ma perché esso funzioni Tokka e Rahzard devono ingerirlo, così le tartarughe inseriscono questo anti-mutageno in alcune ciambelle. Vanno all’appuntamento di Shredder e, quando Tokka e Rahzard arrivano, mangiano il cibo preparato dalle Tartarughe. Qualcosa però va storto, e i nostri eroi sono costretti a combattere; dopo un furioso duello, l’anti-mutageno ha effetto grazie ad un’intuizione del professore e di Donatello, che utilizzando degli estintori, lo fanno agire e Toka e Razard ritornano normali.
A quel punto sulla scena appare Shredder, ha in mano il mutageno, pronto ad usarlo, ma Kinon entra di sorpresa e con un’abile mossa fa cadere dalla mano la fiala al cattivone; il professore lo recupera e tra Shredder e le Tartarughe inizia una nuova battaglia. Quando pensano di averlo neutralizzato egli, che aveva ancora un piccola dose del mutageno, la usa su se stesso: Shredder diventa fortissimo, ma per colpa della sua forza, che non riesce a controllare, distrugge un’impalcatura e perisce nel crollo, la città è di nuovo sicura!

April O'Neil: Paige Turco
Professor Jordon Perry: David Warner
Michelangelo: Michelan Sisti
Donatello: Leif Tilden
Raffaello: Kenn Troum
Leonardo: Mark Caso
Splinter: Kevin Clash
Kinon: Ernie Reyes, Jr.
Shredder: Francois Chau
Tatsu: Toshishiro Obata
Capo Polizia - Sterns: Raymond Serra
Rahzar: Mark Ginther
Tokka: Kurt Bryant
Super Shredder: Kevin Nash

Regista: Michael Pressman
Animazione Personaggi: Jim Henson's Creature Shop
Musiche: John Du Prez
Edited: John Wright, A.C.E. Steve Mirkovich, A.C.E.
Designer di Produzione: Roy Forge Smith
Direttore della Fotografia: Shelly Johnson
Produttore Esecutivo: Raymond Chow
Co-Produttore: Terry Morse
Scritto da: Todd Langen
Produttore: Thomas K. Gary, Kim Dawson and David Chan