La Trama

April O'Neal è una bella e giovane reporter televisiva per conto dell'emittente Canale 3, sta seguendo una serie di storie sull'escalation di furti a New York.
Una sera dopo il suo bollettino, April coglie sul fatto alcuni ladri che stanno tentando di apprezzare un furgone adibito a stazione mobile TV.
L'illuminazione stradale si spegne di colpo, April sente solo il rumore di una lotta. Delle ombre combattono nell'oscurità dietro a lei.
Quando la Polizia arriva trova April stordita ma sana e salva, senza neppure un graffio, con i suoi assalitori stesi a terra intorno a lei.

Nelle fogne di New York, i salvatori di April si svelano: Raffaello, Leonardo, Michelangelo e Donatello - le illustri Giovani Tartarughe Mutanti Ninja - le quali sono ritornate nei loro sotterranei per riferire al loro maestro ninja il topone parlante Splinter.

Dopo qualche buona pizza il burrascoso Raffaello va a Central Park e deve far fronte a un combattimento con Casey Jones un personaggio che si è auto nominato vigilante, che usa come armi una varietà di attrezzi sportivi.
Casey si rivela un abile combattente di arti marziali, egli annuncia che è tempo di salvare di New York dal crimine "Qualcuno lo deve pur fare", dice. Intanto, il crimine continua la sua escalation, April denuncia tramite la TV le mancanze del capo della Polizia Ross Sterns nel mettere ordine nella città.
April compie alcune indagini che la porteranno ai responsabili dell'ondata criminale: un'organizzazione clandestina nota come "Il Clan del Piede" che l'attacca nuovamente nella metropolitana.
Un'altra volta l'eroico Raffaello la salva.

Questa volta, comunque, Raf porta April nel covo delle Tartarughe.
Qui Splinter e le sue Tartarughe raccontano alla scioccata April la storia della loro origine: la caduta nelle fogne di un liquido radioattivo chiamato OOZE che ha permesso alla Tartarughe di crescere fino alla statura di un uomo medio e ha dato loro il dono della parola, ma nello steso tempo ha trasformato Amato Hioshi nel topone parlante Splinter.
Nello stesso tempo che le Tartarughe scortano a casa April, Splinter viene rapito dal "Clan dl Piede".

Dopo che le Tartarughe sono ritornate nel covo provenienti dall'appartamento di April, addolorate e confuse, fanno l'amara scoperta della scomparsa di Splinter.
I soldati del Clan del Piede avevano portato il loro Sensei in un vecchio magazzino, dove Shredder ha costruito il suo impero criminale usando un'armata di allievi ninja come ladri.
Uno di questi è Danny Pennington, il figlio diseredato del capo di April, che ha eseguito gli ordini di Shredder.
Armati delle loro conoscenze, il Clan del Piede lancia un attacco micidiale: demolisce l'appartamento di April e la battaglia si protrae finché tutti i soldati del piede sono messi in fuga dalle Tartarughe e da Casey Jones.
La casa di April è davastata da un furioso incendio.

I nostri eroi arrivano alla casa dell'infanzia di April in aperta campagna, dove le tristi Tartarughe meditano sulla loro sconfitta ognuno per gli affari suoi.

Nella calma serenità della campagna Casey e April si innamorano. Le Tartarughe attraverso una comunicazione extra sensoriale scoprono dove il loro Maestro Splinter è tenuto in ostaggio, scoprendo che la vera forza dei ninja non sta nei muscoli ma nel controllo della mente.
Accordandosi fra loro incominciano nuovamente ad allenarsi .
Con le loro nuove conoscenze e tecniche acquisite le Tartarughe ritornano in città.

Nello stesso istante in cui Casey salva Splinter con l'aiuto di Danny, le Tartarughe ingaggiano la loro battaglia finale con il Clan del Piede - nelle fogne, nelle strade e perfino sui tetti.
La battaglia culmina con la sconfitta di Shredder, che si rivela l'assassino del Maestro Ninja di Splinter.
New York è salva, e le Tartarughe si sono riunite con il loro "Padre".

April O'Neil: Judith Hoag
Casey Jones: Elias Koteas
Raffaello: Li Josh Pais
Michelangelo: Michelan Sisti
Donatello: Leif Tilden
Leonardo: David Forman
Danny Pennington: Michael Turney
Charles Pennington: Jay Patterson
Capo Sterns: Raymond Serra
Shredder: James Saito
Tatsu: Toshishiro Obata

Regia: Steve Barron
Screenplay: Todd W. Langen and Bobby Herbeck from Herbeck's story based on characters created by Kevin Eastman and Peter Laird
Direttore della fotografia: John Fenner
Colonna sonora: John Du Prez
Scenografie: Roy Forge Smith
Prodotto da: Kim Dawson, Simon Fields and David Chan
Pruduttore esecutivo: Raymond Chow.
Durata: 87 minuti.